Arheje so skupina enoceličnih mikroorganizmov, ki imajo tako kot bakterije prokariontsko morfologijo, torej nimajo jedra ali notranjih membranskih organelov, vendar se v bistvu od njih razlikujejo, in sicer tako, da integrirajo svoje okolje. Arheje za postopek fotosinteze ne potrebujejo sončne svetlobe, kot to velja za rastline, prav tako ne potrebujejo kisika.
Večina arhej ima celično steno, sestavljeno iz beljakovin, ki tvorijo togo skupino, ki pokriva zunanjo plast celice in ustvarja zaščitno mrežo, ki kemično in fizično vpliva na celico.
Pomembno je poudariti, da je bila analiza teh mikroorganizmov v svojih začetkih povezana z analizo bakterij, vendar so začeli opazovati njihove edinstvene značilnosti, ki se ne odzivajo nujno z enakimi lastnostmi bakterij in drugih prokariontskih organizmov.
Ta izraz je grškega izvora in pomeni "starodaven", ker imajo starodavne molekularne stroje, ki so se ohranili brez bistvenih sprememb od katere koli druge družine mikroorganizmov.
Ti mikrobi večinoma živijo v ekstremnih okoljih, zato jih imenujejo ekstremofili. Medtem ko obstajajo drugi, ki preživijo v običajnih ravneh slanosti in temperaturah, morda pa obstajajo tudi nekateri, ki živijo v črevesju živih bitij.
Termofilne arheje so tiste, ki živijo v izredno vročih okoljih, medtem ko tiste, ki naseljujejo super slana okolja, imenujemo hipersalinske, pa imajo sposobnost živeti v ekstremnih okoljih, kjer drugi organizmi ne morejo prebivati.
Arheje najdemo v naravi prosto: v izvirih, v tleh itd.
