Mikroorganizme lahko opredelimo kot vrsto majhnih živih bitij do te mere, da so človeškemu očesu nevidni. Ti so lahko različnih vrst, med najpomembnejšimi lahko izpostavimo alge, glive, bakterije itd. Obstajajo tisti, ki trdijo, da so nekateri mikroorganizmi predhodniki življenja na planetu Zemlja, medtem ko druge nekoliko bolj zapletene predpostavke trdijo, da so ti zunajzemeljskega izvora in da so se takrat razširili po obrazu in dali življenje vsemu, kar je danes. Na splošno je zelo pogosto, da so mikroorganizmi sestavljeni iz celice edinstven, vendar to ne pomeni, da ni tistih, sestavljenih iz več kot ene celice.
Zaradi potrebe po soočanju z boleznimi je preučevanje mikroorganizmov imelo velik zagon, zato se je medicina razvijala na enak način kot znanje o teh živih bitjih.
Nekateri mikroorganizmi se štejejo za odgovorne za škodo določenim živilom, ki so lahko škodljiva za tiste posameznike, ki so uživali takšna živila in povzročajo različne bolezni, kljub temu pa obstajajo nekateri mikroorganizmi, ki lahko prispevajo k različnim postopkom, primer tega je fermentacija, pri kateri se omenjeni organizmi uporabljajo za izdelavo živil, kot sta jogurt ali sir, to pomeni, da obstajajo mikroorganizmi, ki lahko spremenijo konfiguracijo nekaterih živil ali celo podaljšajo njihovo življenjsko dobo.
Mikroorganizmi, ki so v naravi največ prisotni, so bakterije, ki jih najdemo v različnih vrstah habitatov. Obstajajo bakterije, ki so lahko škodljive za zdravje ljudi, primer tega je " Escherichia coli ", ki je odgovoren za bolezni, kot je septikemija. Kljub temu obstajajo tudi druge bakterije, ki so lahko koristne za telo, na primer "Lactobacillus acidophilus", ki lahko proizvaja različne snovi, kot sta vitamin K in vodikov peroksid, ki so lahko v veliko pomoč pri organizem.
