Beseda molekula je pomanjševalnica latinske besede "moli", ki pomeni maso, torej molekula pomeni "majhna masa". Molekula je zveza ali niz dveh ali več atomi, ki so lahko enaki ali različni, če so ti atomi ločeni bi spremenili lastnosti snovi.
Molekula stabilen in električno nevtralen sistem, ki je sestavljen iz niza dveh ali več atomi povezane s kemičnimi vezmi, ki se imenujejo kovalentne vezi. Ti atomi so lahko enaki kot pri vodiku (H2) in kisiku (O2), ki sta diatonični molekuli, ali pa jih tvorijo različni atomi, kot je to pri vodi (H2O), ki je sestavljena iz dveh atomov vodika. in en plin iz kisika in metana (CH4), v molekuli katerega so štirje vodikovi atomi, povezani z enim iz ogljika.
Molekula velja najmanjši del, ki jih je mogoče dobiti iz važno, da lahko ohrani svoje kemijske lastnosti. Glavni razlog za nastanek molekul je v tem, da obstajajo atomi, ki ponavadi dosežejo minimalni energetski pogoj, in da to doseže s kovalentnimi vezmi z drugimi atomi, ki so v enakem stanju, te vezi ni mogoče enostavno raztopiti in takrat se rodi molekula.
V snovi molekule, ki jih sestavljajo, niso statične, nasprotno, nenehno se gibljejo, kar imenujemo molekularne vibracije, to pa je lahko upogibanje ali napetost.
