Da bi kemične reakcije pretrgale vezi nekaterih začetnih snovi, potrebujejo aktivirno silo. Temu pravimo reagenti, ki omogočajo pretvorbo začetnih snovi v končne snovi ali izdelke. Encimi so kot dobri katalizatorji odgovorni za povečanje hitrosti kemičnih reakcij in zmanjšanje aktivacijske energije.
Encimi so beljakovine, ki običajno z veliko natančnostjo katalizirajo biokemične reakcije v živih osebkih. Možno je, da obstajajo nekateri encimi z absolutno natančnostjo, to pomeni, da so primerni le za kataliziranje določene reakcije. Primer tega je ureaza, ki je odgovorna za katalizacijo hidrolize sečnine.
Obstajajo tudi drugi encimi, razen skupinske natančnosti, kot je primer proteolitičnih encimov, ki so odgovorni za katalizo hidrolize peptidov z nekaterimi strukturnimi lastnostmi. Obstajajo tudi encimi s stereokemijsko natančnostjo, ki so odgovorni za katalizacijo stereoizomernih reakcij določene molekule in ne druge.
To katalitično gibanje je za večino encimov vzpostavljeno na majhnem območju molekule, znanem kot "aktivno središče". Molekula, na katero encim deluje, se imenuje substrat, ki se veže na aktivno središče in tvori encimski kompleks. Medtem ko je pritrjen na encim, postane substrat produkt in tu je ločen od encima.
Kataliza encim simbolizira naslednjo enačbo:
E + S → ES → E + P, v tem primeru E pomeni encim, S simbolizira substrat, P je produkt reakcije in ES se nanaša na kompleks encim-substrat.
V večini encimskih reakcij je kopičenje encimov veliko manjše kot pri substratu (E <S), zato bo ES manjši od S, kar bo omogočilo uporabo približka v stanju dinamičnega ravnovesja za ES. Med encimsko katalizo bosta temperatura in PH dobro vplivali na pospeševanje reakcije, kar bo favoriziralo obstoj visoko učinkovitih vrednosti, za katere je hitrost reakcije dokončna. Na ta način lahko encime veliko hitreje deaktiviramo, ko temperatura zaradi denaturacije beljakovin doseže vrednosti nad 35 ° C.
